Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3278L7N2D2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3278L7N2D2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms