Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms