Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2888K7N746 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2888K7N746 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2888K7N746 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2888K7N746 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2888K7N746 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2888K7N746 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2888K7N746 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2888K7N746 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2888K7N746 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2888K7N746 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2888K7N746 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms