Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5225J3QPL3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm5225J3QPL3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5225J3QPL3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5225J3QPL3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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