Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisa8J3QNX5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms