Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21788J3QNH3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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