Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm20918J3QN17 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm20918J3QN17 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm20918J3QN17 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm20918J3QN17 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm20918J3QN17 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm20918J3QN17 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20918J3QN17 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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