Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm20834J3QM72 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20834J3QM72 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20834J3QM72 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms