Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6594J3QM43 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6594J3QM43 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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