Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21411J3KMS0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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