Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm20830J3KML6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm20830J3KML6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm20830J3KML6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20830J3KML6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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