Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21719J3KMI9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21719J3KMI9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21719J3KMI9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms