Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc4lG5E8X2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms