Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubgcp6G5E8P0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms