Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r12G5E8G1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r12G5E8G1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms