Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r34G3XA52 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms