Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfgef1G3X9K3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgef1G3X9K3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms