Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp846G3X996 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp846G3X996 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms