Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zkscan2G3X952 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan2G3X952 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms