Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r85G3UW56 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r85G3UW56 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms