Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srp72F8VQC1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms