Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp9yF8VPU6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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