Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Farp1F8VPU2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Farp1F8VPU2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms