Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc37F8VPK0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc37F8VPK0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc37F8VPK0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc37F8VPK0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc37F8VPK0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc37F8VPK0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc37F8VPK0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc37F8VPK0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ttc37F8VPK0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms