Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Igkv1-99F6XWB2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms