Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Crocc2F6XLV1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms