Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms