Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Raph1F2Z3U3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms