Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phldb3E9QAF4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms