Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod3E9QA62 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmod3E9QA62 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms