Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms