Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc74aE9Q9U8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms