Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Cdh18E9Q9Q6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Cdh18E9Q9Q6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cdh18E9Q9Q6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cdh18E9Q9Q6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cdh18E9Q9Q6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cdh18E9Q9Q6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms