Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rdh16f1E9Q9P8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rdh16f1E9Q9P8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Rdh16f1E9Q9P8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rdh16f1E9Q9P8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rdh16f1E9Q9P8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rdh16f1E9Q9P8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rdh16f1E9Q9P8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rdh16f1E9Q9P8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rdh16f1E9Q9P8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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