Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col22a1E9Q7P1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col22a1E9Q7P1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms