Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

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Length 4,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Dnah11E9Q7N9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Dnah11E9Q7N9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Dnah11E9Q7N9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnah11E9Q7N9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Dnah11E9Q7N9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Dnah11E9Q7N9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dnah11E9Q7N9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms