Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc85cE9Q6B2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms