Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ythdc1E9Q5K9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ythdc1E9Q5K9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms