Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms