Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep350E9Q309 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Cep350E9Q309 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Cep350E9Q309 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep350E9Q309 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep350E9Q309 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms