Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms