Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Zfp558E9Q1J0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Zfp558E9Q1J0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Zfp558E9Q1J0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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