Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1B3

Gm7275, Predicted gene 7275, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7275E9Q1B3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm7275E9Q1B3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm7275E9Q1B3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm7275E9Q1B3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm7275E9Q1B3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm7275E9Q1B3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm7275E9Q1B3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm7275E9Q1B3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7275E9Q1B3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms