Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9972E9Q053 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms