Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fndc1E9Q043 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc1E9Q043 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms