Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcom1E9PZ54 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcom1E9PZ54 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms