Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brd1E9PZ26 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms