Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Rsph10bE9PYQ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms