Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca16E9PWJ7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca16E9PWJ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca16E9PWJ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms