Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms